上田市の旧市内の中学校で初めて近村合併で上田市立となった小学校の併設中学校を統合して誕生した中学校である。
上田市立川辺小学校の併設中学校の後身である事から長らく川辺小が学区となっていたが単独校舎所在地(現在地)が
上田市立城下小学校学区にある関係で遠くなり結果、川辺小が
1988年開校の
上田市立第六中学校に分離したため現在は城下小が学区となっている。ただし、
1984年に川辺小の東部地域と城下小の西部地域を学区とする
上田市立南小学校が開校したため川辺小の東部地域のみが開校時からの学区という事になる。